เมื่อร่างกายได้รับในปริมาณที่เพียงพอ จะทำให้เกิดผลที่เป็นประโยชน์ต่อสุขภาพ สามารถจับที่บริเวณผิวของเยื่อบุลำไส้แล้วผลิตสารที่ยับยั้งหรือกำจัดเชื้อจุลินทรีย์ตัวที่ไม่ดี รวมถึงผลิตสารที่ดี มีประโยชน์ต่อร่างกาย
พบได้ในอาหารประเภท โยเกิร์ต นมเปรี้ยว อาหารหมักดอง กิมจิ มิโสะ น้ำส้มสายชูหมัก เป็นต้น
อาหารที่ร่างกายไม่สามารถย่อยหรือดูดซึมได้ที่ลำไส้เล็กจึงจะสามารถเข้าสู่ลำไส้ใหญ่ได้ และจะถูกย่อยสลายโดยโพรไบโอติก (จุลินทรีย์ดี) ทำให้กระตุ้นการเจริญเติบโตและการทำงานของโพรไบโอติกพร้อมทั้งช่วยกระตุ้นการผลิตกรดไขมันสายสั้น (short-chain fatty acids: SCFAs) อย่างบิวทิเรต (butyrate) ซึ่งมีผลต่อการลดการอักเสบ และปกป้องเซลล์บุผิวลำไส้
แหล่งของพรีไบโอติก ผัก (กระเทียม หอมหัวใหญ่ กะหล่ำปลี ต้นหอมญี่ปุ่น) ผลไม้ (กล้วย แอปเปิ้ล อะโวคาโด แตงโม) ถั่ว (ถั่วเหลือง ถั่วแดง) และธัญพืช (ข้าวโอ๊ต ข้าวบาร์เลย์ ข้าวกล้อง)
จึงมีส่วนช่วยปรับสมดุลลำไส้ โดยการเพิ่มจำนวนของจุลินทรีย์ที่ดีในลำไส้ ลดการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ที่ไม่ดี ทำให้การย่อยอาหารดีขึ้น ลดอาการท้องผูกและส่งเสริมระบบภูมิคุ้มกัน แหล่งของซินไบโอติก น้ำนมแม่ โยเกิร์ต นมเปรี้ยว คีเฟอร์ (Kefir)
ที่มีประโยชน์ต่อร่างกาย ได้แก่ กรดไขมันสายสั้น ตัวอย่างเช่น acetate, propionate, butyrate เปปไทด์ที่ออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เอนไซม์ ตัวอย่างเช่น เบต้า-กาแลคโตซิเดส (beta-galactosidase) พอลิแซ็กคาไรด์ และสารต้านอนุมูลอิสระบางชนิด ตัวอย่างเช่น กรดฟีนอลิก (phenolic acid) รวมทั้งจุลินทรีย์ที่ตายแล้วแต่ยังคงไว้ซึ่งโครงสร้างเซลล์และสารชีวภาพที่มีประโยชน์ต่อร่างกาย มีคุณสมบัติที่ช่วยส่งเสริมสุขภาพ ช่วยปรับสมดุลลำไส้และส่งเสริมระบบ ภูมิคุ้มกัน
